يقدم القسم برنامجين للدراسات العليا لنيل درجتي الماجستير في العلوم الصيدلية ودكتوراه الفلسفة في الكيمياء الصيدلية. إضافة لذلك فإن قسم الكيمياء الصيدلية ، بالتعاون مع قسم الصيدلانيات ، يقدم برنامجاً مشتركاً لنيل درجة الماجستير في الرقابة النوعية للمستحضرات الصيدلية. بالإضافة إلى ذلك يساهم القسم في تدريس عدد من المقررات في برنامجي دكتور صيدلة والماجستير التنفيذي في التشريعات الدوائية.